A Leishmaniose Canina é uma doença crónica, cujos sinais clínicos são muito variáveis e que geralmente se iniciam com uma apatia progressiva e uma intolerância insidiosa ao exercício. As lesões da pele são das mais frequentes, geralmente não causam prurido (comichão) e começam com uma perda de pêlo progressiva acompanhada de caspa, que se inicia na cabeça e posteriormente se estende ao resto do corpo. Alguns animais desenvolvem ulcerações (feridas) no nariz e pavilhões auriculares. Entre 20 a 40% dos cães com Leishmaniose Canina desenvolvem lesões oculares. O crescimento exagerado das unhas e o corrimento nasal sanguinolento (epistáxis) são também sinais muito frequentes. A perda de peso e a atrofia muscular são dos sinais mais frequentes quando existe um comprometimento visceral. Alguns animais podem perder peso, mesmo que tenham o aumento do apetite
Quando os cães desenvolvem insuficiência renal crónica, o seu estado geral agrava-se bastante. Nesta fase, os animais podem apresentar perda de apetite, , emitem grandes volumes de urina e ingerem mais água. Nas fases mais adiantadas desta insuficiência podem também apresentar vómito,. e episódios de diarreia. Raramente apresentam febre e se a apresentarem, geralmente, é baixa.
A imunossupressão, causada pela própria doença, pode promover a ocorrência de infecções concomitantes, logo o quadro clínico pode ser complicado por condições como sarna demodécica, dermatite, gastroenterite e pneumonia.